В круг обязанностей отдела службы охраны природных комплексов входят:
- сохранение целостности экосистем и входящих в них природных комплексов;
- осуществление охраны территории и охранной зоны в целях обеспечения установленного режима;
- охрана мест обитания краснокнижных видов растительного и животного мира;
- проведение противопожарных мероприятий  и предупреждение лесных пожаров.

В отделе задействованы 15 государственных инспекторов, включая начальника отдела.
Начальник отдела службы охраны природных комплексов – Базарбаев Галымжан Алиханович